馬鈴薯含有一些有毒的生物鹼，主要是茄鹼和毛殼霉鹼^{[來源請求]}。馬鈴薯中茄鹼含量一般為每公斤30至100毫克，通常認為每公斤200毫克以內食用是安全的，但發芽馬鈴薯芽眼四周和見光變綠部位，茄鹼含量可高達每公斤5克，而茄鹼不會因烹煮加熱而分解，因此食用可能中毒